如果您的发票存根丢失了，可以采取以下措施：
一旦发现发票存根丢失，您应当立即书面报告税务机关，说明情况。
您需要在报刊或电视等传播媒介上刊登声明，宣布发票作废。
您可以向原票据供应单位提出申请，要求重新开具发票，替换丢失的发票。
在申请补开发票时，您需要提供发票类型、号码、原开日期、金额、开票名称等相关信息，以及申请书和有效的相关凭证，以证明发票的真实性和丢失情况。
根据相关规定，您可能需要接受税务机关的处罚，具体处罚措施请咨询当地税务机关。
建议您建立健全的发票管理制度，加强发票存储的安全措施，定期对发票存根联进行清点和审核，确保存根联的完好无损。
您可以凭相关证据向银行提出办理增值税发票代扣代缴税款的申请，及时正确地完成纳税义务。
请根据您具体情况，选择合适的措施进行处理，并确保及时通知相关方，避免不必要的麻烦。