医保查房时病人不在场，根据相关法规，医保不会取消该病人个人的医保报销资格。医保局主要对医院的管理和行为进行监督，如果医院在医保查房时存在违规行为，如病人不在场，医保局可能会对医院进行处罚，这可能包括影响医院的医保基金拨付和医疗服务质量评价。
医院方面，可能会对涉及的科室医护人员进行相应的处罚，医护人员可能会因为无法控制病人行动而承担一定的责任，这可能会影响他们的工作和职业发展。
对于病人而言，虽然个人报销资格不会取消，但擅自离开医院可能会影响治疗效果和康复进度，并可能被视为对医疗资源浪费或滥用，引起社会不满。